國家應用數學中心是進一步貫徹落實國家《關于全面加強基礎科學研究的若幹意見》（國發〔2018〕4号）和《關于加強數學科學研究工作方案》（國科辦基〔2019〕61号）文件精神，由科技部批準設立的國家級科研平台。
吉林應用數學中心成立于2019年9月29日，由吉林大學牽頭，聯合東北師範大學和吉林省計算中心等單位共同建設，是首批獲得支持建設的13個國家應用數學中心之一。這也是繼國家天元數學東北中心之後，依托我校建設的第二個國家級數學中心。
中心圍繞國家加強數學研究的發展戰略，強強聯合，建立開放融合機制，用數學思想、數學方法、數學發現、數學規律引導創新實踐，聚焦數字吉林、新能源汽車、生物醫藥、衛星數據應用等領域，重點開展民用航空輪胎的數學建模與算法、傳染病與動物疫病的建模與分析、主要農作物人工智能育種、遙感數據的處理與産業應用、大氣污染預警等關鍵問題的研究。中心将繼續圍繞國家重大需求，凝煉數學問題，加強科技攻關和引領性原創成果重大突破，以高水平數學研究支撐創新型國家建設和世界科技強國建設。為新時代吉林全面振興、全方位振興貢獻智慧和力量。
吉林應用數學中心自籌建以來，吉林大學始終積極支持中心開展各項工作，在政策制定、運行經費、工作條件等方面全力提供保障，努力把中心建成高水平應用數學和數學應用研究、數學人才培養、應用技術交流的重要基地。